«ИЗВЕСТИЯ ИРКУТСКОГО ГОСУДАРСТВЕННОГО УНИВЕРСИТЕТА». СЕРИЯ «БИОЛОГИЯ. ЭКОЛОГИЯ»
«IZVESTIYA IRKUTSKOGO GOSUDARSTVENNOGO UNIVERSITETA». SERIYA «BIOLOGIYA. ECOLOGIYA»
«THE BULLETIN OF IRKUTSK STATE UNIVERSITY». SERIES «BIOLOGY. ECOLOGY»
ISSN 2073-3372 (Print)

Список выпусков > Серия «Биология. Экология». 2022. Том 40

Молекулярно-генетическая идентификация грибов рода Fomitopsis из Иркутской области

Автор(ы)
Е. А. Орлова, Д. В. Захарова, Б. Н. Огарков, С. Н. Жданова, О. Б. Огарков
Аннотация
Представлены данные молекулярно-генетической и филогенетической идентификации двух штаммов базидиальных грибов Fomitopsis pinicola из Иркутской области, обладающих высоким биотехнологическим потенциалом, как продуценты различных ферментов и биологически активных веществ. Генетическая идентификация биотехнологических штаммов Fomitopsis spp. проведена по последовательности вариабельных участков ITS1 рибосомального оперона. Обсуждаются вопросы современной таксономии F. pinicola, актуальности фармакологических исследований их антиканцерогенных свойств и возможности применения в качестве лекарственных средств и пищевых добавок.
Об авторах

Орлова Елизавета Андреевна, младший научный сотрудник, Научный центр проблем здоровья семьи и репродукции человека, Россия, 664003, г. Иркутск, ул. Тимирязева, 16, e-mail: elizaveta.a.orlova@gmail.com

Захарова Дарья Вячеславовна, магистрант, Иркутский государственный университет, Россия, 664003, г. Иркутск, ул. К. Маркса, 1, e-mail: darya.zaxarova.98@inbox.ru

Огарков Борис Никитович, доктор биологических наук, профессор, заведующий лабораторией, Иркутский государственный университет, Россия, 664003, г. Иркутск, ул. К. Маркса, 1, e-mail: bornik@bk.ru

Жданова Светлана Николаевна, доктор медицинских наук, ведущий научный сотрудник, Научный центр проблем здоровья семьи и репродукции человека, Россия, 664003, г. Иркутск, ул. Тимирязева, 16, e-mail: svetnii73@gmail.com

Огарков Олег Борисович, доктор медицинских наук, заведующий отделом, Научный центр проблем здоровья семьи и репродукции человека, Россия, 664003, г. Иркутск, ул. Тимирязева, 16, e-mail: obogarkov@yandex.ru

Ссылка для цитирования
Молекулярно-генетическая идентификация грибов рода Fomitopsis из Иркутской области / Е. А. Орлова, Д. В. Захарова, Б. Н. Огарков, С. Н. Жданова, О. Б. Огарков // Известия Иркутского государственного университета. Серия Биология. Экология. 2022. Т. 40. С. 15–23. https://doi.org/10.26516/2073-3372.2022.40.15
Ключевые слова
базидиомицеты, Fomitopsis pinicola, ITS1 рибосомального оперона, секвенирование по Сэнгеру, филогенетический анализ.
УДК
57.065
DOI
https://doi.org/10.26516/2073-3372.2022.40.15
Литература

Огарков Б. Н. Mycota – основа многих биотехнологий. Иркутск : Время странствий, 2011. 207 с.

Amplification and direct sequencing of fungal ribosomal RNA genes for phylogenetics in PCR / T. J. White, T. D. Bruns, S. Lee, J. Taylor // PCR Protocols. A Guide to Methods and Applications. Cambridge, MA : Academic Press, 1990. P. 315–322. https://doi.org/10.1016/B978-0-12-372180-8.50042-1

Balandreau J. Ecological factors and adaptive processes in N2-fixing bacterial populations of the plant environment // Plant Soil. 1986. Vol. 90. P. 73–92. https://doi.org/10.1007/BF02277388

Bishop K. S. Characterisation of extracts and anti-cancer activities of Fomitopsis pinicola // Nutrients. 2020. Vol. 12, N 3. P. 609. https://doi.org/10.3390/nu12030609

Edgar R. C. Accuracy of taxonomy prediction for 16S rRNA and fungal ITS sequences // Peer J. 2018. Vol. 6. e4652. https://doi.org/10.7717/peerj.4652

European medicinal polypores – a modern view on traditional uses / U. Grienke, M. Zöll, U. Peintner, J. M. Rollinger // J. Ethnopharmacol. 2014. Vol. 154, N 3. P. 564–583. https://doi.org/10.1016/j.jep.2014.04.030

Fomitopsis mounceae and F. schrenkii – two new species from North America in the F. pinicola complex / E. J. Haight, K. K. Nakasone, A. G. Laursen, A. S. Redhead, L. D. Taylor, A. J. Glaeser // Mycologia. 2019. Vol. 111. P. 339–357. https://doi.org/10.1080/00275514.2018.1564449

Fungal strain matters: colony growth and bioactivity of the European medicinal polypores Fomes fomentarius, Fomitopsis pinicola and Piptoporus betulinus / P. Dresch, K. Rosam, U. Grienke, J. M. Rollinger, U. Peintner // AMB Express. 2015. Vol. 5, N 4. https://doi.org/10.1186/s13568-014-0093-0

Giftson J. S., Jayanthi S., Nalini N. Chemopreventive efficacy of gallic acid, an antioxidant and anticarcinogenic polyphenol, against 1,2-dimethyl hydrazine induced rat colon carcinogenesis // Investig. New Drugs. 2010. Vol. 28. P. 251–259. https://doi.org/10.1007/s10637-009-9241-9

Investigating migration inhibition and apoptotic effects of Fomitopsis pinicola chloroform extract on human colorectal cancer SW-480 cells / Y. Wang, X. Cheng, P. Wang, L. Wang, J. Fan, X. Wang, Q. Liu // PLoS One. 2014. Vol. 9. 7:e101303. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0101303

Karsten P. Symbolae Ad Mycologiam Fennicam. VIII // Meddelanden af Societatis pro Fauna et Flora Fennica. 1881. Vol. 6. P. 7–12. (in Latin). Cited in Binder et al. URL: https://www.biodiversitylibrary.org/item/38778#page/7/mode/1up

Kim K. M., Yoon Y. G., Jung H. S. Evaluation of the monophyly of Fomitopsis using parsimony and MCMC methods // Mycologia. 2005. Vol. 97. P. 812–822. https://doi.org/10.1080/15572536.2006.11832773

Lanostane triterpenoids and triterpene glycosides from the fruit body of Fomitopsis pinicola and their inhibitory activity against COX-1 and COX-2 / K. Yoshikawa, M. Inoue, Y. Matsumoto, C. Sakakibara, H. Miyataka, H. Matsumoto, S. J. Arihara // Nat. Prod. 2005. Vol. 68, N 1. P. 69–73. https://doi.org/10.1021/np040130b

Lindequist U., Niedermeyer T. H., Jülich W. D. The pharmacological potential of mushrooms // Evid. Based Complementary Altern. Med. 2005. Vol. 2, N 3. P. 285–299. https://doi.org/10.1093/ecam/neh107

MYCOBANK Database. Fungal Databases, Nomenclature & Species Banks. URL: https://www.mycobank.org/

Phylogenetic and phylogenomic overview of the Polyporales / M. Binder, A. Justo, R. Riley, A. Salamov, F. Lopez-Giraldez, E. Sjökvist, K. H. Larsson // Mycologia. 2013. Vol. 105. P. 1350–1373. https://doi.org/10.3852/13-003

Phylogeny of Fomitopsis pinicola: a species complex / J. E. Haight, G. A. Laursen, J. A. Glaeser, D. L. Taylor // Mycologia. 2016. Vol. 108. P. 925–938. https://doi.org/10.3852/14-225R1

Sequence-based classification and identification of Fungi / D. Hibbett, K. Abarenkov, U. Kõljalg, M. Öpik, B. Chai, J. Cole, J. R. Herr // Mycologia. 2016. Vol. 108. P. 1049–1068.

Taxonomy and phylogeny of the Fomitopsis pinicola complex with descriptions of six new species from East Asia / S. Liu, M. L. Han, T. M. Xu, Y. Wang, D. M. Wu, B. K. Cui // Front. Microbiol. 2021. Vol. 12. 644979. https://doi.org/10.3389/fmicb.2021.644979

Vilgalys R., Hester M. Rapid genetic identification and mapping of enzymatically amplified ribosomal DNA from several Cryptococcus species // J. Bacteriol. 1990. Vol. 172, N 8. P. 4238–4246. https://doi.org/10.1128/jb.172.8.4238-4246.1990


Полная версия (русская)