«ИЗВЕСТИЯ ИРКУТСКОГО ГОСУДАРСТВЕННОГО УНИВЕРСИТЕТА». СЕРИЯ «БИОЛОГИЯ. ЭКОЛОГИЯ»
«IZVESTIYA IRKUTSKOGO GOSUDARSTVENNOGO UNIVERSITETA». SERIYA «BIOLOGIYA. ECOLOGIYA»
«THE BULLETIN OF IRKUTSK STATE UNIVERSITY». SERIES «BIOLOGY. ECOLOGY»
ISSN 2073-3372 (Print)

Список выпусков > Серия «Биология. Экология». 2011. Том 4

Выявление интеграции генетического материала вируса клещевого энцефалита в геномы человека и других млекопитающих

Автор(ы)
А. И. Парамонов, Ю. П. Джиоев
Аннотация

В ходе поиска участков интеграции генома вируса клещевого энцефалита (ВКЭ) в геномы ряда видов млекопитающих с использованием компьютерного алгоритма BLAST установлен ряд гомологий между геномами ВКЭ и геномами домовой мыши, шимпанзе и человека. Высказано предположение о возможном значении подобных интеграций для животных, восприимчивых к этому вирусу.

Ключевые слова
интеграция участков генома, вирус клещевого энцефалита, геном человека
УДК
578.56
Литература

1. Молекулярная эпидемиология клещевого энцефалита европейской части России и некоторых стран Балтии, Восточной и Юго-Восточной Европы / Р. В. Адельшин [и др.] // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. – 2006. – № 2. – С. 27–34.

2. Basic local alignment search tool / S. F. Altschul [et al.] // J. Mol. Biol. – 1990. – Vol. 215 (3). – P. 403–410.

3. Basic Local Alignment Search Tool. [Электронный ресурс] : сайт. – http://blast.ncbi.nlm.nih.gov

4. Belyi V. A. Sequences from Ancestral Single-Stranded DNA Viruses in Vertebrate Genomes: the Parvoviridae and CircoviridaeAre More than 40 to 50 Million Years Old / V. A. Belyi, J. A. Levine, A. M. Skalka // J. Virol. – 2010. – December 84(23). – P. 12458–12462.

5. Belyi V. A. Unexpected inheritance: multiple integrations of ancient bornavirus and ebolavirus/ marburgvirus sequences in vertebrate genomes / V. A. Belyi, J. A. Levine, A. M. Skalka // PLoS Pathog. – 2010. – Jul 29, 6(7): e1001030.

6. Endogenous non-retroviral RNA virus elements in mammalian genomes / M. Horie [et al.] // Nature. – 010. – Vol. 463. – P. 84–87.

7. Isolation and characterization of Israeli acute paralysis virus, a dicistrovirus affecting honeybees in Israel: evidence for diversity due to intra- and interspecies recombination / E. Maori [et al.] // J. Gen. Virol. – 2007. – Vol. 88. – 3428–3438.

8. Recombination of retrotransposon and exogenous RNA virus results in nonretroviral cDNA integration / M. B. Geuking [et al.] // Science. – 2009. – Vol. 323. – P. 393–396.

9. Sequences of flavivirus-related RNA viruses persist in DNA form integrated in the genome of Aedes spp. mosquitoes / S. Crochu [et al.] // J. Gen. Virol. – 2004. – Vol. 85. – P. 1971–1980.

10. Tanne E. Occurrence of a DNA sequence of a non-retro RNA virus in a host plant genome and its expression: evidence for recombination between viral and host RNAs / E. Tanne, I. Sela / Virology. – 2005. – Vol. 332. – P. 614–622.


Полная версия (русская)