«ИЗВЕСТИЯ ИРКУТСКОГО ГОСУДАРСТВЕННОГО УНИВЕРСИТЕТА». СЕРИЯ «БИОЛОГИЯ. ЭКОЛОГИЯ»
«IZVESTIYA IRKUTSKOGO GOSUDARSTVENNOGO UNIVERSITETA». SERIYA «BIOLOGIYA. ECOLOGIYA»
«THE BULLETIN OF IRKUTSK STATE UNIVERSITY». SERIES «BIOLOGY. ECOLOGY»
ISSN 2073-3372 (Print)

Список выпусков > Серия «Биология. Экология». 2015. Том 12

Генетическая дифференциация скальных полёвок в горностепных районах северо-востока Внутренней Азии

Автор(ы)
Ю. Н. Литвинов, С. А. Абрамов, О. В. Чертилина, Е. П. Симонов, Н. В. Лопатина
Аннотация

На основе изучения изменчивости фрагмента гена цитохром b исследованы филогенетические взаимоотношения пяти видов полёвок рода Alticola. Для реконструкции филогенетических отношений использован метод максимального правдоподобия (ML) и байесовский филогенетический анализ. Полученные результаты существенно дополняют картину филогенетических отношений в роде Alticola за счёт включения в анализ тувинской A. tuvinicus и ольхонской A. olchonensis полёвок. Показано, что ольхонская полёвка представляет собой валидный вид, составляя с хангайской полёвкой A. semicanus и A. tuvinicus единую группу близкородственных видов, сестринскую к плоскочерепной полёвке A. strelzowi.

Ключевые слова
скальные полёвки, филогенетические отношения, ген цитохрома b
УДК
575.174.015.3599.323.5
Литература

1. Генетическое разнообразие плоскочерепной полевки (Alticola strelzowi (Kastschenko, 1899)) по данным об изменчивости гена цитохрома b / О. В. Чертили-на [и др.] // Генетика. – 2012. – Т. 48, № 3. – С. 352–360.

2. Изменчивость и систематика скальных полёвок (Alticola s. str.) Монголии, Тувы, Прибайкалья и Алтая / О. Л. Россолимо [и др.] // Зоол. журн. – 1988. – Т. 67, № 3. – С. 426–437.

3. Литвинов Ю. Н. Морфологическая изменчивость изолированных популяций ольхонской полевки Alticola olchonensis (Rodentia, Arvicolidae) с островов Байкала / Ю. Н. Литвинов, Н. И. Литвинов, А. А. Поздняков // Зоол. журн. – 2000. – Т. 79, № 1. – С. 71–79.

4. Млекопитающие России: систематико-географический справочник / И. Я. Павлинов, А. А. Лисовский (ред.). – М. : Т-во науч. изд. КМК, 2012. – 604 с.

5. Ратнер В. А. О некоторых молекулярных критериях дивергенции, конвергенции и систематики / В. А. Ратнер // Проблемы эволюции. – Новосибирск : Наука, 1972. – Т. 2. – C. 5–27.

6. Россолимо О. Л. Таксономический статус тувинской полевки Alticola (A.) tuvinicus Ognev (Mammalia: Arvicolinae) / О. Л. Россолимо, И. Я. Павлинов, Г. И. Шенброт // Биол. науки. – 1992. – № 6. – С. 58–62.

7. Hall T. A. BioEdit: a user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windows 95/98/NT. / T. A. Hall // Nucl. Acids Symp. – 1999. – Vol. 41. – P. 95–98.

8. Helaers R. MetaPIGA v2.0: maximum likelihood large phylogeny estimation using the metapopulation genetic algorithm and other stochastic heuristics [Electronic resource] / R. Helaers, M. Milinkovitch // BMC Bioinformatics. – 2010. – N 11. – P. 379. – URL : http://biomedcentral.com/1471-2105/11/379

9. Molecular phylogeny of the genus Alticola (Cricetidae, Rodentia) as inferred from the sequence of the cytocrome b gene / V. Lebedev [et al.] // Zoologica Scripta. – 2007. – Vol. 36, N 6. – P. 547–563.

10. Mrbayes 3.2: Efficient bayesian phylogenetic inference and model choice across a large model space. / F. Ronquist [et al.] // Syst. Biol. – 2012. – Vol. 61, N 3. – P. 539–542.

11. Multilocus systematics and non-punctuated evolution of Holarctic Myodini (Rodentia: Arvicolinae) / B. A. Kohli [et al.] // Molecular phylogenetics and evolution. – 2014. – N 76. – P. 18–29.

12. Sambrook J. Molecular Cloning: A Laboratory Manual / J. Sambrook, E. Fritsch, T. Maniatis – N. Y. : Cold Spring Harbor Lab. Press, 1989. – 398 p.

13. TOPALi: Software for Automatic Identification of Recombinant Sequences within DNA Multiple Alignments / I. Milne [et al.] // Bioinformatics – 2004. – Vol. 20, N 11. – P. 1806–1807.


Полная версия (русская)