«ИЗВЕСТИЯ ИРКУТСКОГО ГОСУДАРСТВЕННОГО УНИВЕРСИТЕТА». СЕРИЯ «БИОЛОГИЯ. ЭКОЛОГИЯ»
«IZVESTIYA IRKUTSKOGO GOSUDARSTVENNOGO UNIVERSITETA». SERIYA «BIOLOGIYA. ECOLOGIYA»
«THE BULLETIN OF IRKUTSK STATE UNIVERSITY». SERIES «BIOLOGY. ECOLOGY»
ISSN 2073-3372 (Print)

Список выпусков > Серия «Биология. Экология». 2014. Том 8

Анализ нуклеотидных последовательностей и определение филогенетического положения клещей Dermacentor silvarum

Автор(ы)
Т. А. Болотова, Н. В. Кулакова, М. А. Хаснатинов, Ю. А. Вержуцкая, Е. И. Андаев, С. И. Беликов
Аннотация

Представлены результаты анализа митохондриального гена 16S rRNA и внутреннего нетранслируемого спейсера – ITS2 клещей Dermacentor silvarum, обитающих на территории Иркутской области. Нами установлено высокое генетическое сходство всех исследованных последовательностей D. silvarum. В результате филогенетического анализа было показано, чтоD. silvarum иD. nuttalli являются близкородственными видами, которые не различаются на основе исследуемых молекулярных маркеров. Установлено, что D. silvarum относится к филогенетической ветви, объединяющей евроазиатские виды Dermacentor с наиболееблизкими видамиD. nuttalli и D. marginatus.

Ключевые слова
филогения рода Dermacentor, Dermacentor silvarum, mt 16S rRNA, ITS2
УДК
595.421
Литература

1. Абрамсон Н. И. Молекулярные маркеры, филогеография и поиск критерия разграничения видов / Н. И. Абрамсон // Тр. Зоол. Ин-та РАН, 2009. – Прил. 1. – С. 185–198.

2. Аммосов А. Д. Клещевой энцефалит / А. Д. Аммосов. – Кольцово : Вектор-Бест, 2006. – 115 с.

3. Колонин Г. В. Распространение иксодовых клещей: роды: Dermacentor, Ahocentor, Cosmiomma, Dermacentonomma, Nosomma, Rhipicentor, Rhipicephalus, Boophilus, Margaropus, Anomalohimalaya / Г. В. Колонин отв. ред. Г. П. Сомов. – М. : Наука, 1984. – 96 с.

4. Сердюкова Г. В. Иксодовые клещи фауны СССР / Г. В. Сердюкова. – Л. : Наука, 1956. – 122 с.

5. Филиппова Н. А. Иксодовые клещи подсемейства Amblyomminae / Н. А. Филиппова // Фауна России. – СПб. : Наука, 1997. – 436 с.

6. Филиппова Н. А. Некоторые аспекты внутривидовой изменчивости близко-родственных видов группы Dermacentor marginatus (Acari: Ixodidae) как показатель микроэволюционного процесса / Н. А. Филиппова, М. А. Плаксина // Паразитология. – 2005. – Т. 39, вып. 5. – С. 337–364.

7. Black W.C. 4th Phylogeny of hard- and soft-tick taxa (Acari: Ixodida) based on mitochondrial 16S rDNA sequences / W. C. Black, J. Piesman // Proc Natl Acad Sci USA. – 1994. – Vol. 91, N 21. – P. 10034–10038.

8. Molecular phylogenetic analysis of ixodid ticks based on the ribosomal DNA spacer, internal transcribed spacer 2, sequences / M. Fukunaqa [et al.] // J. Parasitol. – 2000. – Vol. 86, N 1. – P. 38–43.

9. Hall T. A. BioEdit: a user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windows 95/98/NT / T. A. Hall // Nucl. Acids. Symp. Ser. – 1999. – N 41. – P. 95–98.

10. MEGA5: molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods / K. Tamura [et al.] // Molecular Biology and Evolution. – 2011. – N 28. – P. 2731–2739.

11. Kolonin G. V. Fauna of Ixodid ticks of the world (Acari, Ixodidae) [Electronic resource] / G. V. Kolonin. – М., 2009. – URL.: http: //www.kolonin.org.


Полная версия (русская)