«ИЗВЕСТИЯ ИРКУТСКОГО ГОСУДАРСТВЕННОГО УНИВЕРСИТЕТА». СЕРИЯ «БИОЛОГИЯ. ЭКОЛОГИЯ»
«IZVESTIYA IRKUTSKOGO GOSUDARSTVENNOGO UNIVERSITETA». SERIYA «BIOLOGIYA. ECOLOGIYA»
«THE BULLETIN OF IRKUTSK STATE UNIVERSITY». SERIES «BIOLOGY. ECOLOGY»
ISSN 2073-3372 (Print)

Список выпусков > Серия «Биология. Экология». 2019. Том 30

Филогеографическая структура Anemone baicalensis (Ranunculaceae) на основе полиморфизма пластидной ДНК (trnL-trnF) как подтверждение существования плейстоценовых микрорефугиумов на хр. Хамар-Дабан

Автор(ы)
М. В. Протопопова, В. В. Павличенко, Д. А. Орлова, В. В. Чепинога
Аннотация

Представлены результаты исследования современной филогеографической структуры неморального реликта Anemone baicalensis Turcz. на хр. Хамар-Дабан с использованием пластидного ДНК-маркера trnL-trnF. Показана генетическая дифференцированность популяций из западной и восточной частей ареала. Выявленные филогеографические паттерны подтверждают частичную фрагментацию ареала A. baicalensis и сохранение популяций в микрорефугиумах на хр. Хамар-Дабан в течение последних плейстоценовых похолоданий. Определена предполагаемая зона вторичного контакта популяций из «восточной» и «западной» филогеографических групп и их возможной гибридизации после наступления благоприятных условий в голоцене. Результаты позволяют предположить, что географическая обособленность популяций A. baicalensis на восточном пределе распространения вида вдоль хр. Хамар-Дабаннаблюдаемая в низовьях рек, относительна, а зона их вероятного контакта с основной частью ареала находится в субальпийском и горнотаёжном поясах.

Об авторах

Протопопова Марина Владимировна, кандидат биологических наук, старший научный сотрудник, Сибирский институт физиологии и биохимии растений СО РАН, Россия, 664033, г. Иркутск, ул. Лермонтова, 132; доцент, Иркутский государственный университет, Россия, 664003, г. Иркутск, ул. К. Маркса, 1 e-mail: marina.v.protopopova@gmail.com 

Павличенко Василий Валерьевич, кандидат биологических наук, старший научный сотрудник, Сибирский институт физиологии и биохимии растений СО РАН, Россия, 664033, г. Иркутск, ул. Лермонтова, 132; доцент, Иркутский государственный университет, Россия, 664003, г. Иркутск, ул. К. Маркса, 1, e-mail: vpavlichenko@gmail.com 

Орлова Дарья Алексеевна, студент, Иркутский государственный университет, Россия, 664003, г. Иркутск, ул. К. Маркса, 1; инженер, Сибирский институт физиологии и биохимии растений СО РАН, Россия, 664033, г. Иркутск, ул. Лермонтова, 132 

Чепинога Виктор Владимирович, доктор биологических наук, ведущий научный сотрудник, Институт географии им В. Б. Сочавы СО РАН, Россия, 664033, г. Иркутск, ул. Улан-Баторская, 1; профессор, Иркутский государственный университет, Россия, 664003, г. Иркутск, ул. К. Маркса, 1, e-mail: victor.chepinoga@gmail.com

Ссылка для цитирования

Филогеографическая структура Anemone baicalensis (Ranunculaceae) на основе полиморфизма пластидной ДНК (trnL-trnF) как подтверждение существования плейстоценовых микрорефугиумов на хр. Хамар-Дабан / М. В. Протопопова, В. В. Павличенко, Д. А. Орлова, В. В. Чепинога // Известия Иркутского государственного университета. Серия Биология. Экология. 2019. Т. 30. С. 3–15. https://doi.org/10.26516/2073-3372.2019.30.3

Ключевые слова
неморальный реликт, рефугиум, оледенение, ветреница байкальская Anemone baicalensis, молекулярно-генетические маркеры, молекулярно-биологические методы, trnL-trnF
УДК
574.9(575.8)
DOI
https://doi.org/10.26516/2073-3372.2019.30.3
Литература

Ивановский Л. Н. Псевдоледниковые формы рельефа в долине р. Выдриной (Южное Прибайкалье) // География и природные ресурсы. 2006. № 4. С. 161–167.

Ильин М. М. Третичные реликтовые элементы в таежной флоре Сибири и их возможное происхождение // Материалы по истории флоры и растительности СССР. Вып. 1. М. ; Л. : Изд-во АН СССР, 1941. С. 257–292.

Использование генетических маркеров для оценки состояния реликтовых видов растений Байкальской Сибири / М. В. Протопопова, В. В. Павличенко, А. А. Гнутиков, Р. В. Адельшин, В. В. Чепинога // Вестн. Рос. ун-та дружбы народов. Сер. Экология и безопасность жизнедеятельности. 2015. № 4. С. 28–36.

Красная книга Красноярского края. Т. 2. Редкие и находящиеся под угрозой исчезновения виды дикорастущих растений и грибов / Н. В. Степанов [и др.]. Красноярск : Сиб. федер. ун-т., 2012. 576 с.

Красная книга Республики Бурятия: редкие и находящиеся под угрозой исчезновения виды животных, растений и грибов / Р. Ю. Абашеев [и др.]. Улан-Удэ : Изд-во БНЦ СО РАН, 2013. 688 с.

Новые данные о распространении некоторых неморальных реликтовых растений в предгорьях хребта Хамар-Дабан (Южное Прибайкалье) / В. В. Чепинога, А. В. Мишина, М. В. Протопопова, В. В. Павличенко, С. О. Быстров, М. А. Вилор // Ботан. журн. 2015. Т. 100, № 5. С. 478–489.

Перспективы использования внутренних транскрибируемых спейсеров (ITS1 и ITS2) для идентификации редких видов растений на примере рода Waldsteinia (Rosaceae) / М. В. Протопопова, В. В. Павличенко, А. Д. Коновалов, Е. Д. Золотовская, Э. М. Байрамова, В. В. Чепинога // Изв. Иркут. гос. ун-та. Серия «Биология. Экология». 2016. Т. 17. С. 5–11.

Положий А. В., Крапивкина Э. Д. Реликты третичных широколиственных лесов во флоре Сибири. Томск : Изд-во Том. гос. ун-та, 1985. 158 с.

Растительность Прибайкалья как индикатор глобальных и региональных изменений природных условий северной Азии в позднем кайнозое / А. В. Белов, Е. В. Безрукова, Л. П. Соколова, А. А. Абзаева, П. П. Летунова, Е. Э. Фишер, Л. А. Орлова // Геогр. и природ. ресурсы. 2006. № 3. С. 5–18.

Реликтовые комплексы растительности современных рефугиумов северо-восточной Азии / П. В. Крестов, В. Ю. Баркалов, А. М. Омелько, В. В. Якубов, Ю. Накамура, К. Сато // Комаровские чтения. 2009. Т. 56. С. 5–63.

Chepinoga V. V., Protopopova M. V., Pavlichenko V. V. Detection of the most probable pleistocene microrefugia on the northern macroslope of the Khamar-Daban Ridge (Southern Prebaikalia) // Contemporary Problems of Ecology. 2017. Vol. 10, N 1. P. 38–42. https://doi.org/10.1134/S1995425517010036

DNA barcoding of Waldsteinia Willd. (Rosaceae) species based on ITS and trnH-psbA nucleotide sequences / M. Protopopova, V. Pavlichenko, A. Gnutikov, V. Chepinoga // Information Technologies in the Research of Biodiversity. Springer Proceedings in Earth and Environmental Sciences. Cham : Springer Nature Switzerland, 2019. P. 107–115. https://doi.org/10.1007/978-3-030-11720-7_15

Doyle J. J., Doyle J. L. A rapid DNA isolation procedure for small quantities of fresh leaf tissue // Phytochem. Bull. 1987. Vol. 19. P. 11–15.

Felsenstein J. Evolutionary trees from DNA sequences: a maximum likelihood approach // J. Mol. Evol. 1981. Vol. 17, N 6. P. 368–376.

IAPT chromosome data 28 / A. A. Gnutikov, M. V. Protopopova, V. V. Pavlichenko, V. V. Chepinoga // Taxon. 2018. Vol. 67, N 6. P. 1236–1237. https://doi.org/10.12705/676.39

IAPT/IOPB chromosome data 22 / A. A. Gnutikov, M. V. Protopopova, V. V. Pavlichenko, V. V. Chepinoga // Taxon. 2016. Vol. 65, N 5. P. 1200–1207. http://dx.doi.org/10.12705/655.40

IAPT/IOPB chromosome data 26 / A. A. Gnutikov, M. V. Protopopova, V. V. Chepinoga, A. D. Konovalov, E. D. Zolotovskaya, V. V. Pavlichenko // Taxon. 2017. Vol. 66, N 6. P. 1488–1489. https://doi.org/10.12705/666.30

Kumar S., Stecher G., Tamura K. MEGA7: Molecular evolutionary genetics analysis version 7.0 for bigger datasets // Mol. Biol. Evol. 2016. Vol. 33, N 7. P. 1870–1874. https://doi.org/10.1093/molbev/msw054

Mosyakin S. L. Further new combinations in Anemonastrum (Ranunculaceae) for Asian and North American taxa // Phytoneuron. 2018. Vol. 55. P. 1–11.

Tamura K. Estimation of the number of nucleotide substitutions when there are strong transition-transversion and G+C-content bases // Mol. Biol. Evol. 1992. Vol. 9. P. 678–687.

Universal primers for amplification of three non-coding regions of chloroplast DNA // P. Taberlet, L. Gielly, G. Pautou, J. Bouvet // Plant Mol. Biol. 1991. Vol. 17, N 5. P. 1105–1109.


Полная версия (русская)