рус eng
«ИЗВЕСТИЯ ИРКУТСКОГО ГОСУДАРСТВЕННОГО УНИВЕРСИТЕТА». СЕРИЯ «БИОЛОГИЯ. ЭКОЛОГИЯ»
«IZVESTIYA IRKUTSKOGO GOSUDARSTVENNOGO UNIVERSITETA». SERIYA «BIOLOGIYA. ECOLOGIYA»
«THE BULLETIN OF IRKUTSK STATE UNIVERSITY». SERIES «BIOLOGY. ECOLOGY»
ISSN 2073-3372 (Print)

Список выпусков > Серия «Биология. Экология». 2016. Том 17

Перспективы использования внутренних транскрибируемых спейсеров (ITS1 и ITS2) для идентификации редких видов растений на примере рода Waldsteinia (Rosaceae)

Автор(ы)
М. В. Протопопова, В. В. Павличенко, А. Д. Коновалов, Е. Д. Золотовская, Э. М. Байрамова, В. В. Чепинога
Аннотация
Работа направлена на оценку возможности использования нуклеотидных последовательностей ITS регионов для идентификации представителей рода Waldsteinia (Rosaceae). Выявленная в работе степень внутри- и межвидовой вариабельности ITS1 региона обеспечивает возможность его успешного применения для идентификации видов рода Waldsteinia. Выявляемые с помощью молекулярного клонирования низкокопийные варианты ITS1 региона могут быть использованы для идентификации отдельных популяций W. ternata. Для ITS2 региона была отмечена высокая внутривидовая и внутрипопуляционная вариабельность одновременно с низким числом систематических замен, что не позволяет однозначно различать близкородственные виды. Таким образом, ITS2 регион не может быть в полной мере рекомендован для использования в качестве молекулярного маркера для установления видовой принадлежности представителей рода Waldsteinia.
Ключевые слова
ДНК-штрихкодирование, молекулярные маркеры, Waldsteinia, Байкальская Сибирь, неморальные реликты, редкие и исчезающие виды, ITS1, ITS2
УДК
575.852'11357.082.13257.063.7
Литература

1. Использование генетических маркеров для оценки состояния реликтовых видов растений Байкальской Сибири / М. В. Протопопова [и др.] // Вестн. РУДН. Сер. Экология и безопасность жизнедеятельности. – 2015. – Т. 4. – С. 28–36.

2. Красная книга Иркутской области. – Иркутск : Время странствий, 2010. – 480 с.

3. Красная книга Республики Бурятия: редкие и находящиеся под угрозой исчезновения виды животных, растений и грибов. – Улан-Удэ : Изд-во БНЦ СО РАН, 2013. – 688 с.

4. Положий А. В. Реликты третичных широколиственных лесов во флоре Сибири / А. В. Положий, Э.Д. Крапивкина. – Томск : Изд-во Том. гос. ун-та, 1985. – 158 с.

5. Пробатова Н.С. Семейство Розовые – Rosaceae / Н. С. Пробатова, В. Ю. Баркалов // Флора российского Дальнего Востока. – Владивосток : Дальнаука, 2006. – С. 160–168.

6. Шнеер В. С. ДНК-штрихкодирование видов животных и растений – способ их молекулярной идентификации и изучения биоразнообразия / В. С. Шнеер // Журн. общ. биологии. – 2009. – Т. 70, № 4. – С. 296–315.

7. Biological identifications through DNA barcodes / P. D. N. Hebert [et al.] // Proc. Biol. Sci. – 2003. – Vol. 270. – P. 313–321.

8. CBOL Plant Working Group. A DNA barcode for land plants / CBOL Plant Working Group // PNAS. – 2009. – Vol. 106, N 31. – P. 12794–12797.

9. Doyle J. J. A rapid DNA isolation procedure for small quantities of fresh leaf tis-sue / J. J. Doyle, J. L. Doyle // Phytochem. Bull. – 1987. – Vol. 19. – P. 11–15.

10. ITS1: a DNA barcode better than ITS2 in eukaryotes? / X-C. Wang [et al.] // Mol. Ecol. Resour. – 2015. – Vol. 15. – P. 573–586.

11. History and evolution of alpine plants endemic to the Qinghai-Tibetan Plateau: Aconitum gymnandrum (Ranunculaceae) / L. Wang [et al.] // Mol. Ecol. – 2009. – Vol. 9, N 4. – P. 709–721.

12. Land plants and DNA barcodes: short-term and long-term goals / M. W. Chase [et al.] // Philos. Trans. R. Soc. Lond. Biol. Sci. – 2005. – Vol. 360. – P. 1889–1895.

13. Universal Plant DNA Barcode Loci May Not Work in Complex Groups: A Case Study with Indian Berberis Species / S. Roy [et al.] // PLoS ONE. – 2010. – Vol. 5, N 10. – e13674.

14. Utelli A. Molecular and morphological analyses of European Aconitum species (Ranunculaceae) / A. Utelli, B. Roy, M. Baltisberger // Plant Systematics and Evolution. –2000. – Vol. 224. – P. 195–212.


Полная версия (русская)