«ИЗВЕСТИЯ ИРКУТСКОГО ГОСУДАРСТВЕННОГО УНИВЕРСИТЕТА». СЕРИЯ «БИОЛОГИЯ. ЭКОЛОГИЯ»
«IZVESTIYA IRKUTSKOGO GOSUDARSTVENNOGO UNIVERSITETA». SERIYA «BIOLOGIYA. ECOLOGIYA»
«THE BULLETIN OF IRKUTSK STATE UNIVERSITY». SERIES «BIOLOGY. ECOLOGY»
ISSN 2073-3372 (Print)

Список выпусков > Серия «Биология. Экология». 2011. Том 4

Характеристика состава микробных сообществ и оценка качества вод с помощью системы праймеров разного уровня специфичности

Автор(ы)
Н. Л. Белькова, Е. Б. Матюгина, Е. В. Дзюба, Н. Н. Деникина, Е. В. Суханова, М. П. Белых
Аннотация

Комплексный анализ гетеротрофного микробного сообщества в разных лимнических зонах оз. Арахлей в Забайкальском крае в период ранневесенней и летней стратификации позволил установить трофическую устойчивость и основную роль доминирующих гетеротрофов. Показано, что в водоёме в период перехода от гомотермии к стратификации минорные формы находятся в некультивируемом состоянии и не участвуют в основных метаболических циклах. По результатам молекулярно-генетического анализа состава микробных сообществ с помощью системы праймеров разного уровня специфичности и культивирования на селективных питательных средах определён спектр индикаторных гетеротрофных микроорганизмов для оценки качества вод оз. Арахлей.

Ключевые слова
качество воды, гетеротрофные микроорганизмы, оз. Арахлей, молекулярно-генетический анализ, система праймеров
УДК
579.68577.2.08
Литература

1. Белькова Н. Л. Введение в молекулярную экологию микроорганизмов : учеб.-метод. пособие / Н. Л. Белькова, А. М. Андреева. – Ярославль : Издво ООО «Принтхаус», 2009. – 91 с.

2. Белькова Н. Л. Молекулярно-генетические методы анализа микробных сообществ / Н. Л. Белькова // Разнообразие микробных сообществ внутренних водоёмов России : учеб.-метод. пособие.– Ярославль : Принтхаус, 2009. – С. 53–63.

3. Ивано-Арахлейский заказник: природноресурсный потенциал территории / В. А. Обязов [и др.]. – Чита : Поиск, 2002. – С. 21–27.

4. Матюгина Е. Б. Микробные сообщества / Е. Б. Матюгина // Ивано-Арахлейский заказник : природно-ресурсный потенциал территории. – Чита : Поиск, 2002. – С. 75–80.

5. Михеев И. Е. Факторы риска для популяции окуня Perca fluviatilis (озеро Арахлей, Забайкальский край) / И. Е. Михеев, Е. Б. Матюгина // Изв. Самар. науч. центра РАН. – 2010. – Т. 12, № 1 (5). – С. 1317–1320.

6. Молекулярная экология как основа современной методологической базы оценки состояния окружающей среды / С. И. Беликов [и др.] // Изв. Самар. науч. центра РАН. – 2010. – Т. 12, № 1 (4). – С. 1103–1107.

7. Образование некультивируемых форм холерных вибрионов при совместном культивировании с одноклеточными водорослями и продуктами их жизнедеятельности. Холера и патогенные для человека вибрионы / С. В. Титова [и др.]. // Сб. материалов проблемной комиссии. – 2004. – № 17. – С. 37–41.

8. Руководство по медицинской микробиологии. Общая и санитарная микробиология. Кн. 1 / под ред. А. С. Лабинской, Е. Г. Волиной. – М. : Издво БИНОМ, 2008. – 1080 с.

9. Современные подходы и методология экологического мониторинга в условиях водоёма и в аквакультуре / Е. В. Дзюба [и др.] // Изв. Самар. научн. центра РАН. – 2009. – Т. 11, № 1(3). – С. 466–471.

10. Солохина Л. В. Образование покоящихся форм и изменчивость Yersinia pseudotuberculosis под воздействием сине-зелёных водорослей (цианобактерий) и их экзометаболитов / Л. В. Солохина, В. И. Пушкарева, В. Ю. Литвин // Микробиол., эпидемиол. и иммунобиол. – 2001. – № 3. – С. 17–22. 11. Усманов М. Т. Характеристика гидрохимических параметров / М. Т. Усманов, В. Н. Жилин // Ивано-Арахлейский заказник: природно-ресурсный потенциал территории. – Чита : Поиск, 2002. – С. 66–70.

12. Экология микроорганизмов : учеб. для студ. вузов / А. И. Нетрусов [и др.] ред. А. И. Нетрусов. – М. : Академия, 2004. – 272 с.

13. Aeromonas caviae keratitis associated with contact lens wear / A. Pinna [et al.] // Ophthalmology. – 2004. – Vol. 111. – P. 348–351.

14. Atlas R. Handbook of Microbiological Media / R. Atlas. – CRC Press, Inc., Boca Raton, 1993.

15. Bacteremia due to Dietzia maris in an immunocompromised patient / P. Bemer-Melchior // Clin.Infect. Dis. – 1998. – Vol. 29. – P. 1340–1341.

16. Brun E. Faglige vurderinger av behov for kontrolltiltak overfor Flavobacterium psy chrophilum i norsk lakseproduksjon / E. Brun, H. Nilsen, A. B. Olsen. – Norwegian, Oslo, 2009. – report series 13 : National Veterinary Institute. – 20 p.

17. Dale J. W. Molecular Genetics of Bacteria. 5th Edition. / J. W. Dale, S. F. Park. – Chichester : John Wiley and Sons Ltd, 2010. – 400 p.

18. Dietzia, a new genus including Dietzia maris comb. nov., formerly Rhodococcus maris / F. A. Rainey [et al.] // Int. J. Syst. Bacteriol. – 1995. – Vol. 45. – P. 32–36.

19. Donnenberg M. S. Enterobacteriaceae / M. S. Donnenberg // Principles and Practice of Infectious Diseases. – Philadelphia, Pa: Churchill Livingstone, Elsevier, 2010. – Vol. 2, N 7. – P. 2815–2833.

20. Draft ISO/DIS 4833 International Organization for Standardization, 1991.

21. Environmental Microbiology : Current technology and water application / eds.: K. Sen, N. J. Ashbolt. – Norfolk : Caister Academic Press, 2011. – 316 p.

22. Hahn M. W. The filtration-acclimatization method for isolation of an important fraction of the not eadily cultivable bacteria / M. W. Hahn, P. Stadler, L. W. Qinglong // Microbiol. Methods. – 2004. – Vol. 57. – P. 379–390.

23. Oliver J. D. The viable but nonculturable state and cellular resuscitation / J. D. Oliver // Microbial Biosystems : New Frontiers. – Atlantic Canada Soc. Microb. Ecol., Halifax, Canada, 2000. – P. 723–730.

24. PCR troubleshooting and optimization. The essential guide / eds.: S. Kennedy, N. Oswald. – Norfolk : Caister Academic Press, 2011. – 235 p.

25. Sequence similarity searching. FASTA [Electronic recourse]. URL:. http://www.ebi.ac.uk/Tools/sss/ fasta 26. Standard Methods for the Examination of Water and Waste Water 18th ed. / Eds. A. E. Greenberg, L. S. Clesceri, A. D. Eaton. – Washington D.C. : APHA, 1992.

27. The genus Aeromonas / B. Austin [et al.]. – Chichester, U.K. : John Wiley & Sons,;1996. – 350 p.


Полная версия (русская)