Апробированы высокочувствительные методы детекции возбудителей бактериального язвенного синдрома байкальского омуля. В обширных язвенных поражениях внешних покровов байкальского омуля детектированы микроорганизмы филы Цитофаги-Флавобактерии, рода Aeromonas, а также паразитический гриб Saprolegnia ferax. Предполагается, что важнейшими экологическими факторами, определяющими эпизоотическую ситуацию в популяции омуля, являются физиологическое состояние рыб после длительного подлёдного периода с низкой интенсивностью питания, температура воды и плотность стада в период нагула. Обсуждается необходимость проведения микробиологического и паразитологического мониторинга как составляющей части контроля состояния здоровья важнейших видов гидробионтов в озере Байкал.

1. Биоразнообразие бактерий на различных глубинах южной котловины озера Байкал, выявленное по последовательностям 16S рРНК / Л. Я. Денисова [и др.] // Микробиология. – 1999. – Т. 68, № . – С. 547–556.

2. Гидроакустический учёт ресурсов байкальского омуля / отв. ред.: В. И. Кудрявцев, Е. В. Дзюба // Справочники и определители по фауне и флоре озера Байкал. – Новосибирск : Наука, 2009. – 244 с.

3. Елизов В. И. Аэромоноз в регионе Байкала / В. И. Елизов // Биоразнообразие экосистем Внутренней Азии : материалы Всерос. конф. с междунар. участием. Улан-Удэ 5–10 сентября 2006 г. – Улан-Удэ, 2006. – Т. 2. – С. 151–154.

4. Ихтиопатология : учебники и учеб. пособия для студентов высш. учеб. заведений / Н. А. Головина [и др.]. – М. : Мир, 2003. – 448 с.

5. Качество воды озера Байкал, проблемы и перспективы её использования / В. В. Парфенова [и др.] // Водоочистка. Водоподготовка. Водоснабжение. – 2009. – Т. 1. – С. 48–54.

6. Микробиологический мониторинг мелководных участков озера Байкал / О. П. Дагурова [и др.] // Вест. Бурят. ун-та. Сер.: Биология. – 2002. – № 4. – С. 124–127.

7. Определение индикаторных микроорганизмов для мониторинга инфекционных заболеваний рыб на примере Perca fluviatilis (озеро Арахлей, Забайкальский край) / Е. В. Суханова [и др.] // Изв. Самар. науч. центра РАН. – 2010. – Т. 12, № 1(4). – С. 1153–1155.

8. Правдин И. Ф. Руководство по изучению рыб (преимущественно пресноводных) / И. Ф. Правдин.– М. : Пищ. пром-сть, 1966. – 376 с.

9. Пронин Н. М. Об экологических последствиях акклиматизационных работ в бассейне озера Байкал / Н. М. Пронин // Биологические ресурсы Забайкалья и их охрана. – Улан-Удэ : Изд-во БФ СО АН СССР, 1982. – С. 3–18.

10. Салина Е. Г. «Некультивируемые» формы бактерий Mycobacterium smegmatis и Mycobacterium tuberculosis и их биохимическая характеристика : автореф. дис. … канд. биол. наук / Е. Г. Салина. – М., 2006. – 26 с.

11. Становление ассоциированной микрофлоры в онтогенезе байкальского омуля / Е. В. Суханова [и др.] // Пятая Междунар. Верещагин. Байк. конф. : материалы всерос. конф. с междунар. участием. Иркутск, 4–9 октября 2010 г. – Иркутск : Иркут. обл. тип. № 1, 2010. – С. 156.

12. Характеристика биоразнообразия микробного сообщества водной толщи озера Байкал / Н. Л. Белькова [и др.] // Микробиология. – 2003. – Т. 72, № 2. – С. 239–249.

13. Экология, болезни и разведение байкальского омуля / Г. А. Афанасьев [и др.] ред. А. Г. Егоров. – Новосибирск : Наука, 1981. – 232 с.

14. An RT PCR-DGGE survey of gill-associated bacteria in Norwegian seawater-reared Atlantic salmon suffering proliferative gill inflammation / T. Steinum [et al.] // Aquaculture. – 2009. – Vol. 293. – P. 172–179.

15. Austin B. Taxonomy of bacterial fish pathogens / B. Austin // Veterinary Research. – 2011. – Vol. 42. – P. 20.

16. Baudin-Laurencin F. La myxobactéiose viscérale de la truite arc-en-ciel Salmo gairdneri R: Une forme nouvelle de la maladie de l’eau froide à Cytophaga psychrophila / F. Baudin-Laurencin // Acad. Vét. de France. – 1989. – Vol. 62. – P. 147–157.

17. Bioinformatics Toolkit. Web-Pintail [Electronic resource]. – URL: http://www.bioinformaticstoolkit.org/ Pintail/index.html

18. Diagnosis of flavobacteriosis by direct amplification of rRNA genes / M. Tiirola [et al.] // Dis. Aquat. Organ. – 2002. – Vol. 51, N 2. – P. 93–100.

19. Fish Histology and Histopathology Manual / S. Mumford [et al.] // USFWS-NCTC. – 2007. – 357 p.

20. Lonnstrom L.-G. Flavobacterium psychrophilum associated with mortality of farmed perch, Perca fluviatilis L. / L.-G. Lonnstrom, M. L. Hoffren, T. Wiklund // J. Fish Dis. – 2008. – Vol. 31. – P. 793–797.

21. New insights into animal pathogenic oomycetes / A. J. Phillips [et al.] // Trends in Microbiol. – 2007. – Vol. 16, N 1. – P. 13–19.

22. Noga E. J. Water mold infections of freshwater fish: recent advances / E. J. Noga // Annual Rev. of Fish Diseases. – 1993. – P. 291–304.

23. Protective immunity in rainbow trout Oncorhynchus mykiss following immunization with distinct molecular mass fractions isolated from Flavobacterium psychrophilum / B. R. La Frentz [et al.] // Dis. Aquat. Org. – 2004. – Vol. 59. – P. 17–26.

24. Rehulka J. Aeromonas causes severe skin lesions in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss): clinical pathology / J. Rehulka // Haematology and biochemistry. Acta Vet. Brno. – 2002. – Vol. 71. – P. 351–360.

25. Sequence similarity searching. FASTA [Electronic resource]. – URL:. http://www.ebi.ac.uk/Tools/sss/fasta

26. The Health Situation in Farmed Salmonids 2008 / R. Johansen [et al.] // Norwegian National Veterinary Institute, Oslo. – 2009. – 31 p.